当时方位:主页食物资讯食物科技猪端粒到端粒基因组拼装提醒耐寒耐热相关基因
时刻:2025-04-14 13:16来历:我国农业科学院北京畜牧兽医研讨所原文:
中心提示:近来,我国农业科学院北京畜牧兽医研讨所猪遗传育种科学技能立异团队从猪端粒到端粒(T2T)基因组的拼装、着丝粒特征、三代测序查验测验结构变异(SV)、图形泛基因组构建及耐寒和耐热相关基因等方面,全面体系地提醒了猪T2T基因组研讨的重要价值及广泛应用远景。相关研讨成果宣布在《宏(iMeta)》上。
近来,我国农业科学院兽医研讨所猪遗传育种科学技能立异团队从猪端粒到端粒(T2T)基因组的拼装、着丝粒特征、三代测序查验测验结构变异(SV)、图形泛基因组构建及耐寒和耐热相关基因等方面,全面体系地提醒了猪T2T基因组研讨的重要价值及广泛应用远景。相关研讨成果宣布在《宏(ime
当时,世界猪参阅基因组是根据杜洛克猪拼装而成,是猪基因组学研讨的柱石。但是,现在的参阅基因组拼装并未到达T2T水平拼装,约束了猪基因组学的开展。我国地跨寒带到热带,具有世界上最丰厚的猪种资源,其间来自东北冰冷区域的和来自重庆湿热区域的荣昌猪是耐寒和耐热能力强的代表性猪种。本研讨拼装了和荣昌猪两个当地猪种的T2T基因组,并对端粒和着丝粒区域的结构特征提出了新见地。
研讨人员经过泛基因组剖析识别了25,472个基因宗族,其间38.94%是中心基因,60.09%是可变基因,0.97%是私有基因。别的,识别了194,234个高质量的结构变异,构建了图形泛基因组。经过多组学数据整合,发现了耐寒的要害基因TPT1和荣昌猪耐热的要害基因GIMAP6,并在荣昌猪GIMAP6基因上游发现了一个或许增强荣昌猪耐热性的要害骤变。此外,图形泛基因组的构建进一步提升了全基因组相关剖析(GWAS)的数量性状基因座(QTL)数量,并提升了全基因组挑选育种(GS)的准确性。上述研讨成果对未来应对全球变暖等气候适应性猪研讨及相关育种作业供给了理论按照和技能支撑。
我国农业科学院北京畜牧兽医研讨所博士生宗文成、陈力为一起榜首作者,我国农业科学院北京畜牧兽医研讨所张龙超研讨员、王立贤研讨员,重庆市畜牧科学院王金勇研讨员、黑龙江省农业科学院刘娣研讨员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授为一起通讯作者。该研讨得到了国家重点研制方案、重庆市政府与我国农业科学院战略合作项目、优质猪新品种规划与培养项目、我国农业科学院科学技能立异工程等项目的赞助。
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